CUDA Samples: Calculate Histogram(atomicAdd)

以下CUDA sample是分别用C++和CUDA实现的计算一维直方图，并对其中使用到的CUDA函数进行了解说，code参考了《GPU高性能编程CUDA实战》一书的第九章，各个文件内容如下：

funset.cpp:

#include "funset.hpp"
#include <random>
#include <iostream>
#include <vector>
#include <memory>
#include <string>
#include <algorithm>
#include "common.hpp"
#include <opencv2/opencv.hpp>int test_calculate_histogram()
{const int length{ 10 * 1024 * 1024 }; // 100MBstd::unique_ptr<unsigned char[]> data(new unsigned char[length]);generator_random_number<unsigned char>(data.get(), length, 0, 255);const int hist_size{ 256 };std::unique_ptr<size_t[]> hist1(new size_t[hist_size]), hist2(new size_t[hist_size]);std::for_each(hist1.get(), hist1.get() + hist_size, [](size_t& n) {n = 0; });std::for_each(hist2.get(), hist2.get() + hist_size, [](size_t& n) {n = 0; });float elapsed_time1{ 0.f }, elapsed_time2{ 0.f }; // millisecondssize_t value1{ 0 }, value2{ 0 };int ret = calculate_histogram_cpu(data.get(), length, hist1.get(), value1, &elapsed_time1);if (ret != 0) PRINT_ERROR_INFO(calculate_histogram_cpu);ret = calculate_histogram_gpu(data.get(), length, hist2.get(), value2, &elapsed_time2);if (ret != 0) PRINT_ERROR_INFO(calculate_histogram_gpu);if (value1 != value2) {fprintf(stderr, "their values are different: val1: %d, val2: %d\n", value1, value2);return -1;}for (int i = 0; i < hist_size; ++i) {if (hist1[i] != hist2[i]) {fprintf(stderr, "their values are different at: %d, val1: %d, val2: %d\n",i, hist1[i], hist2[i]);return -1;}}fprintf(stderr, "test calculate histogram: cpu run time: %f ms, gpu run time: %f ms\n", elapsed_time1, elapsed_time2);return 0;
}

calculate_histogram.cpp:

#include "funset.hpp"
#include <chrono>
#include "common.hpp"int calculate_histogram_cpu(const unsigned char* data, int length, size_t* hist, size_t& value, float* elapsed_time)
{auto start = std::chrono::steady_clock::now();for (int i = 0; i < length; ++i) {++hist[data[i]];}value = 0;for (int i = 0; i < 256; ++i) {value += hist[i];}auto end = std::chrono::steady_clock::now();auto duration = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(end - start);*elapsed_time = duration.count() * 1.0e-6;return 0;
}

calculate_histogram.cu:

#include "funset.hpp"
#include <iostream>
#include <algorithm>
#include <memory>
#include <vector>
#include <cuda_runtime.h> // For the CUDA runtime routines (prefixed with "cuda_")
#include <device_launch_parameters.h>
#include "common.hpp"/* __global__: 函数类型限定符;在设备上运行;在主机端调用,计算能力3.2及以上可以在
设备端调用;声明的函数的返回值必须是void类型;对此类型函数的调用是异步的,即在
设备完全完成它的运行之前就返回了;对此类型函数的调用必须指定执行配置,即用于在
设备上执行函数时的grid和block的维度,以及相关的流(即插入<<<   >>>运算符);
a kernel,表示此函数为内核函数(运行在GPU上的CUDA并行计算函数称为kernel(内核函
数),内核函数必须通过__global__函数类型限定符定义); */
__global__ static void calculate_histogram(const unsigned char* data, int length, size_t* hist)
{/* __shared__: 变量类型限定符；使用__shared__限定符，或者与__device__限定符连用，此时声明的变量位于block中的共享存储器空间中，与block具有相同的生命周期，仅可通过block内的所有线程访问；__shared__和__constant__变量默认为是静态存储；在__shared__前可以加extern关键字，但表示的是变量大小由执行参数确定；__shared__变量在声明时不能初始化；可以将CUDA C的关键字__shared__添加到变量声明中，这将使这个变量驻留在共享内存中；CUDA C编译器对共享内存中的变量与普通变量将分别采取不同的处理方式 */// clear out the accumulation buffer called temp since we are launched with// 256 threads, it is easy to clear that memory with one write per thread__shared__  size_t temp[256]; // 共享内存缓冲区temp[threadIdx.x] = 0;/* __syncthreads: 对线程块中的线程进行同步；CUDA架构将确保，除非线程块中的每个线程都执行了__syncthreads()，否则没有任何线程能执行__syncthreads()之后的指令;在同一个block中的线程通过共享存储器(sharedmemory)交换数据，并通过栅栏同步(可以在kernel函数中需要同步的位置调用__syncthreads()函数)保证线程间能够正确地共享数据；使用clock()函数计时，在内核函数中要测量的一段代码的开始和结束的位置分别调用一次clock()函数，并将结果记录下来。由于调用__syncthreads()函数后，一个block中的所有thread需要的时间是相同的，因此只需要记录每个block执行需要的时间就行了，而不需要记录每个thread的时间 */__syncthreads();/* gridDim: 内置变量,用于描述线程网格的维度,对于所有线程块来说,这个变量是一个常数,用来保存线程格每一维的大小,即每个线程格中线程块的数量.一个grid最多只有二维,为dim3类型；blockDim: 内置变量,用于说明每个block的维度与尺寸.为dim3类型,包含了block在三个维度上的尺寸信息;对于所有线程块来说,这个变量是一个常数,保存的是线程块中每一维的线程数量;blockIdx: 内置变量,变量中包含的值就是当前执行设备代码的线程块的索引;用于说明当前thread所在的block在整个grid中的位置,blockIdx.x取值范围是[0,gridDim.x-1],blockIdx.y取值范围是[0, gridDim.y-1].为uint3类型,包含了一个block在grid中各个维度上的索引信息;threadIdx: 内置变量,变量中包含的值就是当前执行设备代码的线程索引;用于说明当前thread在block中的位置;如果线程是一维的可获取threadIdx.x,如果是二维的还可获取threadIdx.y,如果是三维的还可获取threadIdx.z;为uint3类型,包含了一个thread在block中各个维度的索引信息 */// calculate the starting index and the offset to the next block that each thread will be processingint i = threadIdx.x + blockIdx.x * blockDim.x;int stride = blockDim.x * gridDim.x;while (i < length) {/* atomicAdd: 原子操作,底层硬件将确保当执行这些原子操作时，其它任何线程都不会读取或写入地址addr上的值。原子函数(atomicfunction)对位于全局或共享存储器的一个32位或64位字执行read-modify-write的原子操作。也就是说，当多个线程同时访问全局或共享存储器的同一位置时，保证每个线程能够实现对共享可写数据的互斥操作：在一个操作完成之前，其它任何线程都无法访问此地址。之所以将这一过程称为原子操作，是因为每个线程的操作都不会影响到其它线程。换句话说，原子操作能够保证对一个地址的当前操作完成之前，其它线程都不能访问这个地址。atomicAdd(addr,y)：将生成一个原子的操作序列，这个操作序列包括读取地址addr处的值，将y增加到这个值，以及将结果保存回地址addr。 */atomicAdd(&temp[data[i]], 1);i += stride;}// sync the data from the above writes to shared memory then add the shared memory values to the values from// the other thread blocks using global memory atomic adds same as before, since we have 256 threads,// updating the global histogram is just one write per thread!__syncthreads();// 将每个线程块的直方图合并为单个最终的直方图atomicAdd(&(hist[threadIdx.x]), temp[threadIdx.x]);
}int calculate_histogram_gpu(const unsigned char* data, int length, size_t* hist, size_t& value, float* elapsed_time)
{/* cudaEvent_t: CUDA event types,结构体类型, CUDA事件,用于测量GPU在某个任务上花费的时间,CUDA中的事件本质上是一个GPU时间戳,由于CUDA事件是在GPU上实现的,因此它们不适于对同时包含设备代码和主机代码的混合代码计时 */cudaEvent_t start, stop;// cudaEventCreate: 创建一个事件对象,异步启动cudaEventCreate(&start);cudaEventCreate(&stop);// cudaEventRecord: 记录一个事件,异步启动,start记录起始时间cudaEventRecord(start, 0);unsigned char* dev_buffer{ nullptr };size_t* dev_hist{ nullptr };// cudaMalloc: 在设备端分配内存cudaMalloc(&dev_buffer, length);cudaMalloc(&dev_hist, 256 * sizeof(size_t));/* cudaMemcpy: 在主机端和设备端拷贝数据,此函数第四个参数仅能是下面之一:(1). cudaMemcpyHostToHost: 拷贝数据从主机端到主机端(2). cudaMemcpyHostToDevice: 拷贝数据从主机端到设备端(3). cudaMemcpyDeviceToHost: 拷贝数据从设备端到主机端(4). cudaMemcpyDeviceToDevice: 拷贝数据从设备端到设备端(5). cudaMemcpyDefault: 从指针值自动推断拷贝数据方向,需要支持统一虚拟寻址(CUDA6.0及以上版本)cudaMemcpy函数对于主机是同步的 */cudaMemcpy(dev_buffer, data, length, cudaMemcpyHostToDevice);/* cudaMemset: 存储器初始化函数,在GPU内存上执行。用指定的值初始化或设置设备内存 */cudaMemset(dev_hist, 0, 256 * sizeof(size_t));// cudaDeviceProp: cuda设备属性结构体// kernel launch - 2x the number of mps gave best timingcudaDeviceProp prop;// cudaGetDeviceProperties: 获取GPU设备相关信息cudaGetDeviceProperties(&prop, 0);// cudaDeviceProp::multiProcessorCount: 设备上多处理器的数量int blocks = prop.multiProcessorCount;fprintf(stderr, "multiProcessorCount: %d\n", blocks);/* <<< >>>: 为CUDA引入的运算符,指定线程网格和线程块维度等,传递执行参数给CUDA编译器和运行时系统,用于说明内核函数中的线程数量,以及线程是如何组织的;尖括号中这些参数并不是传递给设备代码的参数,而是告诉运行时如何启动设备代码,传递给设备代码本身的参数是放在圆括号中传递的,就像标准的函数调用一样;不同计算能力的设备对线程的总数和组织方式有不同的约束;必须先为kernel中用到的数组或变量分配好足够的空间,再调用kernel函数,否则在GPU计算时会发生错误,例如越界等;使用运行时API时,需要在调用的内核函数名与参数列表直接以<<<Dg,Db,Ns,S>>>的形式设置执行配置,其中：Dg是一个dim3型变量,用于设置grid的维度和各个维度上的尺寸.设置好Dg后,grid中将有Dg.x*Dg.y个block,Dg.z必须为1;Db是一个dim3型变量,用于设置block的维度和各个维度上的尺寸.设置好Db后,每个block中将有Db.x*Db.y*Db.z个thread;Ns是一个size_t型变量,指定各块为此调用动态分配的共享存储器大小,这些动态分配的存储器可供声明为外部数组(extern __shared__)的其他任何变量使用;Ns是一个可选参数,默认值为0;S为cudaStream_t类型,用于设置与内核函数关联的流.S是一个可选参数,默认值0. */// 当线程块的数量为GPU中处理器数量的2倍时，将达到最优性能calculate_histogram << <blocks * 2, 256 >> >(dev_buffer, length, dev_hist);cudaMemcpy(hist, dev_hist, 256 * sizeof(size_t), cudaMemcpyDeviceToHost);value = 0;for (int i = 0; i < 256; ++i) {value += hist[i];}// cudaFree: 释放设备上由cudaMalloc函数分配的内存cudaFree(dev_buffer);cudaFree(dev_hist);// cudaEventRecord: 记录一个事件,异步启动,stop记录结束时间cudaEventRecord(stop, 0);// cudaEventSynchronize: 事件同步,等待一个事件完成,异步启动cudaEventSynchronize(stop);// cudaEventElapseTime: 计算两个事件之间经历的时间,单位为毫秒,异步启动cudaEventElapsedTime(elapsed_time, start, stop);// cudaEventDestroy: 销毁事件对象,异步启动cudaEventDestroy(start);cudaEventDestroy(stop);return 0;
}

执行结果如下：可见使用C++和CUDA实现的结果是完全一致的：

GitHub：https://github.com/fengbingchun/CUDA_Test