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具体做法如下：
方法一：(工程没有引用外部jar包时，直接导出)
选中工程---->右键，Export...--->Java--->JAR file--->next-->选择jar file的路径及名称-->next-->next---> 选择main class--->finish.
方法2：
当工程引用了其他的外部jar时，由于eclipse不支持同时导出外部jar包的功能，所以比较麻烦一点；具体步骤如下：
生成manifest file:选中工程--->右键，Export--->Java--->JAR file--->选择jar file的路径及名称--->next--->next--->next；
此时来到了方法1中要选择main class的窗口，但这里先不选择main class，选择最上方的Generate the manifest file, 勾上Save the manifest in the workspace,在Manifest file：中输入file的名称，如/testProject/main,（其中testProject为工程名,main为manifest file的名称）点击finish，回到工程，打开刚刚生成的main，在这里要输入如下信息：
Manifest-Version: 1.0
Main-Class: com.pacong.convert.auto.propertes.ConvertAutoProperties
Class-Path: jxl.jar
其中，Manifest-Version: 1.0为刚刚自动生成的manifest版本号；
Main-Class: com.pacong.convert.auto.propertes.ConvertAutoProperties为main class所在类；
Class-Path: jxl.jar为外部jar包名称，这里是告诉导出的jar包，所要用到的外部的jar包的路径及名称。
上面都做完了就可以导出带外部jar包的jar包了，步骤如下：
选中工程--->右键，Export--->Java--->JAR file--->选择jar file的路径及名称--->next--->next--->next，这时又来到了选择main class的窗口，但这里也不选择main class，选择Use existing manifest from workspace，在Manifest file:里选择刚刚生成的main,如：/testProject/main，点击finish，到此就大功告成啦；假设生成的jar包的名称为test.jar，那么Class-Path中引入的jxl.jar要和test.jar位于同一个目录下。
这里还有一点要注意：
如果想在命令行中运行刚刚生成的jar，命令如下：
java -jar test.jar
如果在jar中有一些System.out.prinln语句，运行后想看看打印出的内容，可以用一下命令：
java -jar test.jar >log.txt
输出信息会被打印到log.txt中，当然log.txt自动生成，并位于和test.jar一个目录中。
这里也可以新建一个start.bat文件，创建后；右键---编辑，输入:java -jar test.jar >log.txt；以后直接双击start.bat即可运行test.jar啦。
此部分来自CSDN博客，转载请标明出处：http://blog.csdn.net/kanfeikanfei/archive/2009/03/25/4024304.aspx
补充：
上面第二种方法对于含有较多第三方jar文件就显得不合适，太繁琐。这时可以使用一个打包的插件：fat jar。
附：图解Fat jar的使用
Fat Jar Eclipse Plug-In是一个可以将Eclipse Java Project的所有资源打包进一个可执行jar文件的小工具，可以方便的完成各种打包任务，我们经常会来打jar包，但是eclipse自带的打jar似乎不太够用，Fat Jar是eclipse的一个插件，特别是Fat Jar可以打成可执行Jar包，并且在图片等其他资源、引用外包方面使用起来更方便。
安装方法：
1. eclipse在线更新方法：
help >software updates >Search for new features to install>new update site>
填写name 和url
name：Fat Jar
url:http://kurucz-grafika.de/fatjar，这个是FatJarUpdateSite.
2. eclipse插件安装方法：
下载，地址在http://downloads.sourceforge.net/fjep/net.sf.fjep.fatjar_0.0.27.zip?modtime=1195824818&big_mirror=0，解压后将解压出的plugins中的文件复制到eclipse中的plugins目录下，然后重启eclipse，避免Fat Jar被认不出来，在eclipse启动时使用-clean参数。
使用方法(我用的eclipse是eclipse 3.3.2，Fat Jar是net.sf.fjep.fatjar_0.0.27)：
Fat Jar 打包插件，可以方便的完成各种打包任务，可以包含外部的包等 。呵呵！很好用...../，关于下载和安装就不说了，都很简单。怎么使用？、一开始我也搞了很久，网上说的都不是很详细，可以打包，但双击却运行不了。现在终于搞定了，就上来说一下。
开始：在你的工程项目里右键弹出下图：
然后Buile Fat Jar出现下图：
再然后就Next了，又出现下图：
再然后就没了。在桌面上找到刚刚打包的libr.jar双击，终于成功了，酷啊！！！！
